Налогообложение в период начала Нового времени напоминало средневековое, когда налоги собирали с земли и домашнего хозяйства. Кроме того, налоги в период Эдо также брали с товаров и услуг, оказываемых ремесленниками, торговцами, мастеровыми, охотниками, рыбаками и другими лицами, не платившими земельный налог на постоянной основе.

Основной земельный налог в период начала Нового времени рассчитывали на основании приблизительного количества неотшлифованного риса, выращивавшегося на конкретном участке земли. Этот приблизительный подсчет основывался на результатах земельной переписи, проведенной по приказу Тоётоми Хидэёси в конце XVI в. Урожай риса измерялся объемными мерами коку. Землевладельцы платили налог с этого приблизительного количества риса (кокудака). Размер и значение определенной провинции, в частности, определялись количеством ежегодного рисового налога (измеряемого в кокудака) или общим производством риса. В тех случаях, когда речь шла о доменах владетелей, общее производство риса также определяло количество воинов, которых должен был выставлять феодал в качестве одного из своих обязательств перед сёгуном.

Еще один налог, известный как курамай (амбарный рис), крестьяне платили рисом сёгуну или феодалу. Собранный рис (май) хранили в амбарах (кура) и выплачивали в качестве жалованья слугам сёгуна и феодалов. Крестьяне и земледельцы также платили еще один налог, величина которого высчитывалась на основании урожая риса в деревне. Этот налог (хонтомоно- тари) обыкновенно взимался рисом, хотя иногда его платили деньгами.

Помимо земельных, существовали налоги, которыми правительство обкладывало торговцев, ремесленников и прочих людей, землю не имевших и потому не подлежавших обложению земельным налогом. Уплата этого налога производилась обычно деньгами, а иногда продуктами или физическим трудом. Таким налогом (мегакин) облагались как отдельные личности, так и торговые объединения.

Еще одну важную роль богатые торговцы играли в качестве финансистов и ростовщиков. Их основными клиентами оказывались феодалы, чьи финансовые возможности нередко оказывались перенапряженными благодаря требованию проводить каждый второй год в Эдо. Им приходилось содержать срезу две резиденции и возить свое имущество и скарб в Эдо и обратно. Чтобы еще более затруднить положение феодалов-дяйлеё, сёгунат иногда требовал, чтобы они оплачивали дополнительные расходы по различным проектам, инициированным правительством. В результате феодалы часто испытывали финансовые трудности. Торговцы устанавливали высокие процентные ставки на эти займы, чтобы защитить себя от неплатежей (также имевших иногда место). Проценты обычно платили рисом.